No ano de 2045, após um desastre econômico conhecido como Padrão Global Sincronizado, os rápidos desenvolvimentos na IA impulsionaram o mundo a entrar em um estado de "Guerra Sustentável". No entanto, o público não está ciente da ameaça que a IA representa para a raça humana. A ciborgue Motoko Kusanagi e seu segundo em comando Batou, são ex-membros da Seção 9 de Segurança Pública, que agora são mercenários que viajam na devastada costa oeste americana. Esta terra é cheia de oportunidades para a major e sua equipe, que utilizam seus ciber-cérebros aprimorados e habilidades de combate desde o tempo em que trabalham na Seção 9. No entanto, as coisas ficam complicadas com o surgimento dos "pós-humanos", que têm extrema inteligência e poderes físicos. Os membros da Seção 9 voltam a se reunir novamente para enfrentar essa nova ameaça.
